Notei que os aquisitivos do funcionário estão duplicados, o que pode ter ocorrido e como corrigir?

Quando ocorre queda de energia e o sistema se encerra inesperadamente, isto realmente pode ocorrer, o ideal é que possua um nobreak, que é um dispositivo de proteção (a bateria), que em casos como este de queda de energia ou variações de eletricidade, protege seus equipamentos eletrônicos, funcionando como uma fonte de alimentação. Isto também evita que os aparelhos queimem.

Quanto a sua atual situação, poderá apenas excluir os aquisitivos duplicados e deixar os corretos. Faça um backup antes, como precaução a não excluir algo de forma indevida.